تأسس نادي معيذر الرياضي عام 1996 تحت اسم الشباب وتغير إلى معيذر في 2004 م وتم إشهاره في العام 1998، ويعتبر موسم 2013-2014 أول موسم للفريق في دوري نجوم قطر، بعد أن أمضى المواسم الماضية بدوري الدرجة الثانية. 

وسعى الفريق للصعود لدوري نجوم قطر بعد حصوله على المركز الثاني في دوري أندية الدرجة الثانية لموسم 2011-2012 ولعب المباراة الفاصلة مع فريق أم صلال وخسرها بنتيجة 0-1. 

وفي موسم 2012/2013، تكرر نفس الأمر ولعب الفاصلة مع فريق العربي الذي فاز عليه 2-1 ليبقى الفريقان في دوري نجوم قطر بعد أن استفاد معيذر من قرار اتحاد الكرة بزيادة عدد فرق البطولة الى 14 فريق، وهو الأمر الذي صعد به لدورى النجوم مع فريق الأهلى الذي تأهل رسميا للبطولة، واستمرت مساعي نادي معيذر في التأهل الى دوري نجوم اكسبو حتى تحقق له ذلك موسم 2022ـ2023 ليكون أحد فرق دوري نجوم أكسبو للموسم الكروي 2023ـ2024.